Se le llama “ramas” a las líneas del árbol, y estas muestran la relación entre especies o linajes en su ascendencia o descendencia. Dependiendo del tipo del árbol, algunas características de la rama serán relevantes otorgando más información como la longitud el más conocido.

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En la punta de las ramas encontramos a los organismos que queremos evaluar (ingroup). Estos pueden ser entes que estén vivos actualmente, o bien seres extintos. Las especies serían las “hojas” de nuestro árbol.